Evaluación de genes de referencia en el ostión del norte Argopecten purpuratuas (Lamarck, 1819) /
Castillo Granado, Fernanda Ester
Evaluación de genes de referencia en el ostión del norte Argopecten purpuratuas (Lamarck, 1819) / Fernanda Castillo Granado - hojas varias : ilustraciones, gráficos.
Bibliografía: hojas 82 - 101
Los análisis de expresión de genes son cada vez más importantes en la investigación
biológica, y la PCR cuantitativa en tiempo real (RT -qPCR) se convirtió en un método de alto
rendimiento y rápida cuantificación para los estudios de expresión génica. El método de
normalización más común para compensar las variaciones experimentales está basado en la
utilización de genes de control interno denominados genes de referencia, y la elección de
estos, se ha vuelto un paso crucial para su posterior validación y uso.
Los moluscos bivalvos pertenecientes a la familia Pectinidae (Mollusca: Bivalvia),
son uno de los grupos más diversos en morfología, conducta y biología. Actualmente se
reconocen alrededor de 270 especies, entre ellas Argopecten purpuratus, comúnmente
conocido como concha de abanico en Perú y ostión del norte en Chile. Para esta especie se
han llevado a cabo estudios genético-moleculares relacionados a reproducción y sistema
inmune, analizando su expresión en diferentes estados de desarrollo gonadal o siendo
sometidos a condiciones experimentales con agentes patógenos y/o metales pesados. Dichos
estudios han utilizado genes de referencia para normalizar sus resultados mediante qPCR, sin
embargo, sólo unos pocos genes de referencia han sido validados para esta especie. Este
trabajo busca expandir el repertorio de existente de genes de referencia en esta especie, para
su utilización en futuros estudios de expresión génica.
Contrastando datos de RNA-Seq de Mizuhopecten yessoensis y una base de datos del
transcriptoma de Argopecten purpuratus, se generó un panel de genes de referencia
candidatos in silico, se procedió con su caracterización molecular, y dos secuencias fueron
seleccionadas para ser posteriormente evaluadas mediante qPCR, obteniéndose valores de Ct
para diferentes estados de desarrollo gonadal. Los resultados muestran diferencias
significativas entre los diferentes estados de desarrollo gonadal para ambos genes, lo que
sugiere que no serían aptos candidatos, sin embargo, futuras investigaciones son necesarias
para determinar y descartar absolutamente su uso como posibles genes de referencia.
OSTION DEL NORTE DE CHILE
CARACTERIZACION MOLECULAR
Evaluación de genes de referencia en el ostión del norte Argopecten purpuratuas (Lamarck, 1819) / Fernanda Castillo Granado - hojas varias : ilustraciones, gráficos.
Bibliografía: hojas 82 - 101
Los análisis de expresión de genes son cada vez más importantes en la investigación
biológica, y la PCR cuantitativa en tiempo real (RT -qPCR) se convirtió en un método de alto
rendimiento y rápida cuantificación para los estudios de expresión génica. El método de
normalización más común para compensar las variaciones experimentales está basado en la
utilización de genes de control interno denominados genes de referencia, y la elección de
estos, se ha vuelto un paso crucial para su posterior validación y uso.
Los moluscos bivalvos pertenecientes a la familia Pectinidae (Mollusca: Bivalvia),
son uno de los grupos más diversos en morfología, conducta y biología. Actualmente se
reconocen alrededor de 270 especies, entre ellas Argopecten purpuratus, comúnmente
conocido como concha de abanico en Perú y ostión del norte en Chile. Para esta especie se
han llevado a cabo estudios genético-moleculares relacionados a reproducción y sistema
inmune, analizando su expresión en diferentes estados de desarrollo gonadal o siendo
sometidos a condiciones experimentales con agentes patógenos y/o metales pesados. Dichos
estudios han utilizado genes de referencia para normalizar sus resultados mediante qPCR, sin
embargo, sólo unos pocos genes de referencia han sido validados para esta especie. Este
trabajo busca expandir el repertorio de existente de genes de referencia en esta especie, para
su utilización en futuros estudios de expresión génica.
Contrastando datos de RNA-Seq de Mizuhopecten yessoensis y una base de datos del
transcriptoma de Argopecten purpuratus, se generó un panel de genes de referencia
candidatos in silico, se procedió con su caracterización molecular, y dos secuencias fueron
seleccionadas para ser posteriormente evaluadas mediante qPCR, obteniéndose valores de Ct
para diferentes estados de desarrollo gonadal. Los resultados muestran diferencias
significativas entre los diferentes estados de desarrollo gonadal para ambos genes, lo que
sugiere que no serían aptos candidatos, sin embargo, futuras investigaciones son necesarias
para determinar y descartar absolutamente su uso como posibles genes de referencia.
OSTION DEL NORTE DE CHILE
CARACTERIZACION MOLECULAR